1936年1月，红一军团的指挥部及红1团、红13团抽调了精干骨干以及两个连队，共185人，同时，陕北地方红军也加入了其中，最终重新组建了红3团，团长由曾保堂担任，政委则是肖锋，红3团被划归到同时重建的红1师的建制之下。随着抗日战争的全面爆发，1937年8月20日，红1师被编入八路军115师，并组成独立团，而红3团也随之改编为独立团的第3营，营内共有4个步兵连。平型关战役胜利后，独立团第3营跟随杨成武开辟了抗日根据地，前往蔚县。到1937年11月，第3营与第1营一同扩编，合并成晋察冀军区独立第1师第1团。

　　新成立的晋察冀军区独立第1师第1团，编制由6个原红军连队组成，包括独立团第1营的2连、3连、4连，以及第3营的1连、2连、3连。此外，红3团团部则被改编成了1团第3营的营部。独立团第3营中的第4连被调出，并与原独立团第1营的1连、2营的1、2连合并，组成了新的3团，并以第4连为基础，扩编为3团的第3营。后来，第4连先后编入了晋察冀军区第六支队（邓华支队）的31大队3营，冀热辽挺进军第6团3营，晋察冀军区5分区6团3营，直到1949年1月，最终改编为63军189师566团2营4连，1954年又改编为567团1连。

　　1943年11月，晋察冀军区第1团进行了重新编制，从一个大团缩编成了包含5个步兵连的小团。1连由原1连和2连（这两个连来自红1团的红2、3连）合并而成；2连则是由5连和6连合并而来；5连则由原红3团的第3连与第12连合并而成；3连由红1团的第1、2、3营各抽调一个连所组成；而4连则是通过从红1团和红3团中抽调一部分连队构成的。这样的编制安排保证了其中有相当一部分连队仍保留了红军的血脉，特别是1连，它是完全由原红军连组成的。4连和5连的编制也沿用了部分红军连的阵地和装备。

　　1944年3月，第1团被调归到教2旅，并前往延安进行毛主席的保卫工作。1945年8月，部队接到进军东北的命令。届时，第1团的2连已经被调出并重新编入了延安教导旅第1团。此时，第1团下辖的4个步兵连分别是1、2、3、4连。1945年9月，第1团的第4连（包括原红3团第2连）被拆分并编入了李运昌指挥的部队，而该连队最终并未保持下来。1945年12月，第1团与冀东18总队合并组建了27旅70团，并将原3个连扩编为3个营。

　　1946年1月，1团团长丁胜率领第2营的4、5连调出，原第4连的前身为红3团的第3连，而第5连则是红1团侦察排的继承。1948年11月，第2营的4连和5连被分别改编为45军135师405团的第1连和第2连，其中405团的第1连也即为红3团第3连的沿革传承。之后，这个连队最终演变为54集团军162师486团的红一连。

　　丁胜率领的第2营4、5连调出后，第1团又重新建立了新的2营，并恢复了4、5连。此后，第1团改编成了四野48军142师424团，随后又沿革为55集团军163师487团。其中，487团的9连最初的组成来自于八路军115师独立团第3营的第1连，而这个连队最初的历史可以追溯到1936年1月成立的红1军团红1师红3团第1连。487团3营的机枪连，其前身是红3团的机枪排，也属于红军连之一，是红3团所传承下来的4个红军连之一。

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